Next Generation Sequencing (NGS)

Next Generation Sequencing (NGS)

Illumina_MiSeq

Il servizio di sequenziamento tramite MiSeq (Illumina) comprende:

  1. Controllo di qualità dei campioni in ingresso
  2. Preparazione delle librerie
  3. Sequenziamento e consegna dei raw data all’utente (FastQ)

Tra le principali applicazioni:

Metagenomica: Studio di popolazioni microbiche attraverso il sequenziamento delle regioni ipervariabili (V1-V9) del gene 16S

Target resequencing: Studio di pannelli di geni predefiniti o personalizzati dall’utente. É possibile studiare sia l’espressione dei geni (RNA) che la sequenza (DNA) per identificare SNP, CNV, indel, etc...

eDNA sequencing: studio della biodiversitá attraverso il monitoraggio degli ecosistemi mediante il sequenziamento di campioni di DNA ambientale provenienti ad es. da acqua di mare, suolo, etc...

miRNA e small RNA

sequenziamento di piccoli genomi (virus, batteri)

Questionario e social

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