Centro Servizi di Ateneo per la Ricerca (CeSAR)
Next Generation Sequencing (NGS)
Il laboratorio di genomica offre il servizio di sequenziamento (short and long-reads) tramite la seguente strumentazione:
- Illumina NextSeq 2000
- Illumina MiSeq
- Oxford Nanopore MinIon
Il servizio comprende:
- Controllo di qualità dei campioni inviati
- Preparazione delle librerie
- Sequenziamento e consegna dei raw data all’utente (FastQ)
Tra le principali applicazioni:
- Studi di trascrittomica (sequenziamento di mRNA e RNA totale)
- Whole-exome sequencing
- Metagenomica: studio di popolazioni microbiche attraverso il sequenziamento delle regioni ipervariabili (V1-V9) del gene rRNA 16S
- Target resequencing: Studio di pannelli di geni predefiniti o personalizzati dall’utente. É possibile studiare sia l’espressione dei geni (RNA) che la sequenza (DNA) per identificare SNP, CNV, indel, etc...
- miRNA and small RNA
- sequenziamento di piccoli genomi (virus, batteri)