Next Generation Sequencing (NGS)
Il servizio di sequenziamento tramite MiSeq (Illumina) comprende:
- Controllo di qualità dei campioni in ingresso
- Preparazione delle librerie
- Sequenziamento e consegna dei raw data all’utente (FastQ)
Tra le principali applicazioni:
Metagenomica: Studio di popolazioni microbiche attraverso il sequenziamento delle regioni ipervariabili (V1-V9) del gene 16S
Target resequencing: Studio di pannelli di geni predefiniti o personalizzati dall’utente. É possibile studiare sia l’espressione dei geni (RNA) che la sequenza (DNA) per identificare SNP, CNV, indel, etc...
eDNA sequencing: studio della biodiversitá attraverso il monitoraggio degli ecosistemi mediante il sequenziamento di campioni di DNA ambientale provenienti ad es. da acqua di mare, suolo, etc...
miRNA e small RNA
sequenziamento di piccoli genomi (virus, batteri)