La Facoltà di Medicina e Chirurgia ha la disponibilità delle Aule situate presso il blocco F e l’Asse I della Cittadella Universitaria di Monserrato per un totale di 25 aule con capienza tra i 30 e gli 80 posti.
Dispone, inoltre, di un numero variabile di aule (con posti da 50 a 170) presso il blocco H e il  blocco G della Cittadella per i Corsi di studio della Facoltà di Medicina e Chirurgia.

Il Corso di Laurea in Infermieristica viene erogato in replica anche a Nuoro, dove utilizza le aule della sede didattica del Consorzio UniNuoro.

Sulla base del numero di studenti, dei calendari delle lezioni e degli esami di ciascun CdS la Segreteria di Presidenza o le Segreterie didattiche di ciascun corso provvedono alla prenotazione, tramite sistema informatico, delle Aule necessarie.