1. Nuove molecole per la diagnosi precoce della malattia di Parkinson: identificazione e meccanismo molecolare attraverso il microscopio virtuale (in collaborazione con il Dott. Giuseppe Sforazzini, Dipartimento di Chimica).

Il progetto di ricerca “Self-Control Binding (SCB) Architectures for Parkinson’s Disease Diagnostic” finanziato dalla Fondazione di Sardegna, si prefigge di sviluppare nuove molecole “sonda” per la diagnosi precoce della malattia di Parkinson tramite la rilevazione di aggregati della proteina alfa-sinucleina. Il/la candidato/a utilizzerà programmi di docking e dinamica molecolari, allo scopo di: 1. ottenere informazioni strutturali ed energetiche sull’isomerizzazione delle molecole “sonda” dovuta all’interazione con due fotoni; 2. identificare le strutture più probabili delle molecole legate alla proteina alfa-sinucleina sia in forma monomerica, sia in forma di aggregato.

Abilità richieste

1. Motivazione e curiosità.

2. Conoscenza minimale del sistema operativo Linux.

Abilità auspicate

1. Dimestichezza con i concetti di docking e dinamica molecolari.

2. Interesse verso la biologia.

1. New probes for Parkinson’s Disease: unveiling mechanism behind early diagnosis with the Virtual Microscope (in collaboration with Dr. Giuseppe Sforazzini, Chemistry Department).

Within the project “Self-Control Binding (SCB) Architectures for Parkinson’s Disease Diagnostic” funded by the Fondazione di Sardegna, we aim at developing new probes for the early diagnosis of Parkinson’s Disease, through detection of small/medium size alpha-synuclein aggregates. The candidate should use software available in the group to perform molecular dynamics and docking calculations. The aim is twofold: 1. To obtain structural and energetic insights into the two-photon isomerization of the probe compounds; 2. To identify the most likely structures of the probes bound to the protein target in his monomeric and aggregated forms.

Skills

Requested

1. Motivation and curiosity

2. Basic knowledge of the Linux environment

Desirable

1. Expertise in molecular docking and molecular dynamics simulations

2. Interest in biology