Dipartimento di Scienze della Vita e dell’Ambiente

DATA E LUOGO DI NASCITA

  • 4 Novembre 1959 - Livorno (Toscana)

ISTRUZIONE

  • 1978-1982 – Laurea in Sc. Biologiche (2-18-1983) Università di Pisa;
  • 1983-1987 – Dottorato di Ricerca in Sc. Antropologiche (10-5-87) dell'Università di Firenze.

IMPIEGHI ACCADEMICI (luogo, data e posizione):

  • Università di Pisa, Istituto di Antropologia (1983-1987): post-laurea
  • Università di Cape Town (Sud Africa), Dipartimento di Archeologia (1988): post-doc, Direttore: A. Sillen
  • Università di Pisa, Istituto di Antropologia (1989- 90): assistente di ricerca a contratto
  • Università di Stanford (USA), Dipartimento di Genetica (1991-1992): assistente di ricerca, Direttore: LL. Cavalli-Sforza
  • Università di Sassari, Dipartimento di Zoologia e Antropologia Biologica (1992-1903): Ricercatore in Antropologia (BIO/08)
  • Università di Sassari, Dipartimento di Scienze Biomediche (2004-2018): Professore Associato di Genetica (BIO/18)
  • Università di Cagliari, Dipartimento di Scienze della Vita e dell’Ambiente (2018-2019): Professore Associato di Genetica (BIO/18)
  • Università di Cagliari, Dipartimento di Scienze della Vita e dell’Ambiente (2019-oggi): Professore Ordinario di Genetica (BIO/18)

ABILITAZIONI SCIENTIFICHE

  • 2014 ASN prima fascia in Antropologia (BIO/08), settore concorsuale 05/B1
  • 2016 ASN prima fascia in Genetica (BIO/18), settore concorsuale 05/I1

ATTIVITÀ DIDATTICA

  • 1995-2004 - Professore supplente di Antropologia per Scienze Naturali e Scienze Biologiche - Università di Sassari.
  • 1996-2004 - Professore supplente di Genetica delle Popolazioni per Scienze Ambientali (fino al 2000) e Naturali – Università di Sassari
  • 2004-2018 - Professore titolare di Genetica, Genetica Molecolare e Genetica Evoluzionistica per Scienze Biologiche, Scienze Naturali (sia lauree triennali che specialistiche) e Biotecnologie (solo triennale) - Università di Sassari
  • 2008-2018 - Visiting professor per il Master in Biomedicina Molecular, Università di Alicante (Spagna)
  • 2016-2018 - Visiting professor per il Master in Medical Biotechnologies, Università di Hue (Vietnam)
  • Dal 2018 a oggi - Professore titolare di Genetica per Biologia (triennale) - Università di Cagliari
  • Direttore di 2 tesi di dottorato in Genetica Evoluzionistica Umana (Università di Sassari)
  • Co-direttore del 1 tesi di dottorato in Antropologia Biologica (Universitat Autonoma de Barcelona)

RELATORE INVITATO

  • Relatore invitato a numerosi congressi nazionali e internazionali. 
  • Relatore per seminari, conferenze, scuole estive presso le seguenti università e istituzioni accademiche, nazionali ed internazionali: Università italiane: Pisa, Firenze, Torino, Milano, Insubria (Varese), Bologna, Roma "Tor Vergata", Cagliari, Bari, Palermo, Messina, Perugia - Università straniere: Harvard-MIT, Philadelphia, Princeton-IAS (Stati Uniti d'America), Göttingen, Mainz (Germania), Barcellona, Autonoma di Barcellona, Alicante (Spagna), Komotini (Grecia), Corte (Francia), Wroclaw (Polonia), Ponta Delgada (Portogallo).

INTERESSI DI RICERCA

  • Analisi del DNA mitocondriale e del cromosoma Y nella popolazione umana
  • Analisi del DNA da tessuti antichi
  • Filogenesi Molecolare e Genetica di Popolazioni di vertebrati, invertebrati e microorganismi

ATTIVITÀ EDITORIALE

  • Associate Editor di BMC Evolutionary Biology
  • Revisore per le seguenti riviste internazionali: Annals of Human Genetics, Human Biology, PLoS Biology, PLoS One, BMC Genomics, Human Mutations, GigaScience, e altre

ASSOCIAZIONE A SOCIETÀ SCIENTIFICHE

  • Associazione Genetica Italiana (AGI)
  • Società Italiana di Biologia Evoluzionistica (SIBE)
  • Associazione Antropologi Italiani (AAI)

ATTIVITÀ ACCADEMICA

  • 1992-1993 Coordinatore locale della Facoltà di Scienze per il Progetto Interuniversitario di cooperazione (PIC) "Erasmus" con l'Università Autonoma di Barcellona (Spagna), l'Università di Wroclaw (Polonia), con l'Università di Komotini (Grecia), con l''Università delle Azzorre a Ponta Delgada (Portogallo)
  • 1993-2009: rappresentante per la Facoltà di Scienze: Progetto Socrates / Erasmus.
  • 2009-2010: rappresentante per la Facoltà di Scienze: Progetto CRUI Stage / MAE.

ATTIVITÀ DI RICERCA

  • Partecipazione a progetti scientifici nazionali ed internazionali:
  • 1989-1990 Collaboratore al progetto tra Italia e Spagna (azioni integrate): "Studio comparativo di metodologie per l'analisi paleonutrizionale". In collaborazione con l'Universitat Autónoma de Barcelona.
  • 1992-1993 Coordinatore locale del progetto CNR "Archivio Biologico”: sottoprogetto Antropologia
  • 1997 Progetto italo-spagnolo (azioni integrate): "Analisi del DNA mitocondriale in antiche popolazioni del Mediterraneo", in collaborazione con l'Universitat Autónoma de Barcelona.
  • 1997-1999 Partecipante al progetto CNR "Archivio Biologico" coordinato da L.Terrenato
  • 1998-2003 Collaboratore al progetto PRIN coordinato da G. De Stefano.
  • 1999-2003 Partecipante al progetto Interreg con l'Università di Corte (Corsica)
  • 2000-2006 Collaboratore presso il Centro di Eccellenza istituito presso l'Università di Sassari
  • 2003-2005 Collaboratore al progetto PRIN coordinato da G. Paoli.
  • 2003-2005 Collaboratore al progetto Interreg III con l'Università di Corte (Corsica), Cagliari (Sardegna) e Pisa (Toscana)
  • 2011-2013 Collaboratore al progetto PRIN coordinato da G. Paoli.
  • 2010-2011 Responsabile della RAS di progetto " Filogenesi ad alta risoluzione del cromosoma Y umano"
  • 2016-2017 Responsabile del progetto Fondazione BdS “The Asinara mass graves of Austro-Hungarian prisoners, a biological archive of WWI”

ATTIVITÀ ORGANIZZATIVA CONGRESSUALE

  • 11-12 / 3/2000 Irgoli (NU) - Organizzazione del convegno nazionale: "Irgoli: biodemografia e genetica delle popolazioni che usano cognomi"
  • 2-5 / 10/2008 Alghero (SS) Organizzazione del congresso internazionale della Società Italiana di Biologia Evoluzionistica (SIBE)

SELEZIONE DELLE PRINCIPALI PUBBLICAZIONI

  • CM Calò, G Vona, R Robledo, P Francalacci (2021) From old markers to next generation: reconstructing the history of the peopling of Sardinia. ANNALS OF HUMAN GENETICS 48, 203-212 - doi.org/10.1080/03014460.2021.1944312

  • ME Ghiani, A Mameli, C Vecchio, P Francalacci, R Robledo, CM Calò (2021) Estimating population genetics and forensic efficiency of the GlobalFiler PCR amplification kit in the population of Sardinia (Italy). GENE 794,145775 - doi.org/10.1016/j.gene.2021

  • CM Calò, F Onali, R Robledo, L Flore, M Massidda; P Francalacci (2021) Worldwide variation of the COL14A1 gene is shaped by genetic drift rather than selective pressure. MOLECULAR GENETICS & GENOME MEDICINE doi.org/10.1002/mgg3.1629

  • V Grugni, A Raveane, G Colombo, C Nici, F Crobu, L Ongaro, V Battaglia, D Sanna, N Al-Zahery, O Fiorani, A Lisa, L Ferretti, A Achilli, A Olivieri, P Francalacci, A Piazza, A Torroni, O Semino (2019) Y-chromosome and surname analyses for reconstructing past population structures: The sardinian population as a test case. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES 20(22),5763

  • P Anagnostou, V Dominici, C Battaggia, A Lisi, S Sarno, A Boattini, C Calò, P Francalacci, G Vona, S Tofanelli, MG Vilar, V Colonna, L Pagani, G Destro Bisol (2019) Inter-individual genomic heterogeneity within European population isolates. PLOS ONE 14(10),e0214564

  • CEG. Amorim, S Vai, C Posth, Al Modi, I Koncz, S Hakenbeck, MC La Rocca, B Mende, D Bobo, W Pohl, L Pejrani Baricco, E Bedini, P Francalacci, C Giostra, T Vida, D Winger, U von Freeden, S Ghirotto, M Lari, G Barbujani, J Krause, D Caramelli, PJ Geary, KR Veeramah (2018) Understanding 6th-century barbarian social organization and migration through paleogenomics. NATURE COMMUNICATIONS 9:3547
  • P Anagnostou, V Dominici, C Battaggia, L Pagani, M Vilar, RS Wells, D Pettener, S Sarno, A Boattini, P Francalacci, V Colonna, G Vona, CM Calò, G Destro Bisol, S Tofanelli (2017) Overcoming the dichotomy between open and isolated populations using genomic data from a large European dataset. SCIENTIFIC REPORTS 7: 41614
  • M Simón, N Díaz, E Solórzano, R Montiel, P Francalacci, A Malgosa (2017) Dissecting mitochondrial dna variability of balearic populations from the bronze age to the current era. AMERICAN JOURNAL OF HUMAN BIOLOGY 29:  e22883 
  • P. Francalacci, D. Sanna, A. Useli, R. Berutti, M. Barbato, M. B Whalen, A. Angius, C. Sidore, S. Alonso, S. Tofanelli, F. Cucca (2015) Detection of phylogenetically informative polymorphisms in the entire euchromatic portion of human Y chromosome from a Sardinian sample. BMC RESEARCH NOTES 8 (1), 174
  • S.Tofanelli, L.Taglioli, S.Bertoncini, P. Francalacci, A.Klyosov, L.Pagani (2014) Mitochondrial and Y chromosome haplotipe motifs as diagnostic markers od Jewish ancestry: a reconsideration. FRONTIERS IN GENETICS doi:10.3389/gene2014.00384
  • E. Elhaik, T Tatarinova, D Chebotarev, IS. Piras, CM Calò, A De Montis, M Atzori, M Marini, S Tofanelli, P. Francalacci, L Pagani, C Tyler-Smith, Y Xue, F Cucca, TG. Schurr, JB. Gaieski, C. Melendez, MG. Vilar, AC. Owings, R. Gomez, R. Fujita, F.Santos, D Comas, O Balanovsky, E Balanovska, P Zalloua, H Soodyall, R Pitchappan, A GaneshPrasad, M Hammer, SR.Wells, and the Genographic Consortium (2014) Geographic Population Structure (GPS) of worldwide human populations infers biogeographical origin down to home village. NATURE COMMUNICATIONS. DOI:10.1038/ncomms4513
  • M. Capocasa, P. Anagnostou, V. Bachis, C. Battaggia, S. Bertoncini, G. Biondi, A. Boattini, I. Boschi, F. Brisighelli, C.M. Calò, M. Carta, V. Coia, L. Corrias, F. Crivellaro, V. Dominici, G. Ferri, P. Francalacci, Z.A. Franceschi, D. Luiselli, L. Morelli, O. Rickards, R. Robledo, D. Sanna, E. Sanna, S. Sarno, S. Tofanelli, G. Vona, D. Pettener, G. Destro Bisol (2014) Linguistic, geographic and genetic isolation: a collaborative study on Italian populations JOURNAL OF ANTHROPOLOGICAL SCIENCES 92 doi: 10.4436/jass92001
  • P.Francalacci, L.Morelli, A.Angius, R.Berutti, F.Reinier, R.Atzeni, R.Pilu, F.Busonero, A.Maschio, I.Zara, D.Sanna, A.Useli, M.F.Urru, M.Marcelli, R.Cusano, M.Oppo3, M.Zoledziewska, M.Pitzalis, F.Deidda, E.Porcu, F.Poddie, H.M.Kang, R.Lyons, B.Tarrier, J.Bragg Gresham, B.Li, S.Tofanelli, S.Alonso, M.Dei, S.Lai, A.Mulas, M.B.Whalen, S.Uzzau, C.Jones, D.Schlessinger, G.R.Abecasis, S.Sanna, C.Sidore,, F.Cucca (2013) Low pass DNA sequencing of 1,200 Sardinians reconstructs European Y chromosome phylogeny. SCIENCE 341:565-569
  • E. Elhaik, E. Greenspan, S. Staats, T. Krahn, C. Tyler-Smith, Y. Xue, S. Tofanelli, P. Francalacci, F. Cucca, L. Pagani, L. Jin, H. Li, T. G. Schurr, B. Greenspan, R. S. Wells, and the Genographic Consortium. (2013) The GenoChip: A New Tool for Genetic Anthropology. GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION, doi:10.1093/gbe/evt066
  • L. Alvarez, C. Santos, A. Ramos, R. Pratdesaba, P. Francalacci, M.P. Aluja (2010) Mitochondrial DNA Patterns in the Iberian Northern Plateau: Population Dynamics and Substructure of the Zamora Province. AMERICAN JOURNAL OF PHYSICAL ANTHROPOLOGY doi: 10.1002/ajpa.21252
  • L. Morelli, D. Contu, F. Santoni, M.B. Whalen, P. Francalacci, F. Cucca (2010) A Comparison of Y-Chromosome Variation in Sardinia and Anatolia is More Consistent with Cultural Rather than Demic Diffusion of Agriculture. PLOS ONE, 5: e10419
  • K. Nalam, A. Ahmed, S. Manjulata Devi, P. Francalacci, M. Baig, L. A. Sechi, R. A. Hartskeerl, N. Ahmed (2010) Genetic Affinities within a Large Global Collection of Pathogenic Leptospira: Implications for Strain Identification and Molecular Epidemiology PLOS ONE 5(8): e12637 doi:10.1371/journal.pone.0012637
  • M. Pala, A. Achilli, A.Olivieri, B. Hooshiar Kashani, U.A. Perego, D. Sanna, E. Metspalu, K. Tambets, E. Tamm, M. Accetturo, V. Carossa, H. Lancioni, F. Panara, B. Zimmermann, G. Huber, N. Al-Zahery, F. Brisighelli, S. R. Woodward, P. Francalacci, W. Parson, A. Salas, D. M. Behar, R. Villems, O. Semino, H-J. Bandelt, A. Torroni (2009) Mitochondrial Haplogroup U5b3: a Distant Echo of the Epipaleolithic in Italy and the Legacy of the Early Sardinians. AMERICAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS 86: 814-821
  • D Contu, L Morelli, F Santoni JW. Foster, P.Francalacci, F Cucca (2008) Y-Chromosome Based Evidence for Pre-Neolithic Origin of the Genetically Homogeneous but Diverse Sardinian Population: Inference for Association Scans. PLOS ONE
  • P. Francalacci, D. Sanna (2008) History and Geography of human Y-chromosome in Europe: a SNP perspective. JOURNAL OF ANTHROPOLOGICAL SCIENCES, 86: 59-89
  • SM.Devi, I.Ahmed, P.Francalacci, MA Hussain, Y Akhter, A Alvi, LA Sechi, F Mégraud, N Ahmed (2007) Ancestral European roots of Helicobacter pylori in India. BMC GENOMICS 8:184
  • D Caramelli, C Vernesi, S Sanna, L Sampietro, M Lari, L Castrì, G Vona, R Floris, P.Francalacci, R Tykot, A Casoli, J Bertranpetit, C Lalueza-Fox, G Bertorelle, G Barbujani (2007) Genetic variation in prehistoric Sardinia. HUMAN GENETICS
  • C.Santos, R.Montiel, N.Angles, M.Lima, P.Francalacci, A.Malgosa, A.Abade, M.P.Aluja (2004) Determination of human Caucasian mitochondrial DNA haplogroups by means of a hierarchical approach. HUMAN BIOLOGY 76: 431-453
  • P.Francalacci, L.Morelli, P.A.Underhill, A.S.Lillie, G.Passarino, A.Useli, R. Madeddu, G.Paoli, S.Tofanelli, C.M.Calò, M.E.Ghiani, L.Varesi, M.Memmi, G.Vona, P.Oefner, P.Shen, L.L.Cavalli-Sforza (2003) The peopling of three Mediterranean islands (Corsica, Sardinia and Sicily) inferred by Y-chromosome biallelic variability. AMERICAN JOURNAL OF PHYSICAL ANTHROPOLOGY 121:270-279
  • D.Contu, L.Morelli, P.Zavattari, R.Lampis, E.Angius, Frongia, D.Murru, M.Maioli, P.Francalacci, J.A. Todd, F. Cucca (2002) Sex related bias and exclusion mapping of the non-recombinant portion of chromosome Y in human type 1 diabetes in the isolated founder population of Sardinia. DIABETES 51: 3573-3576
  • A Torroni, HJ Bandelt,V Macaulay, M Richards, F Cruciani, C Rengo, V Martinez-Cabrera, RVillems, T Kivisild, E Metspalu, JR Parik, HV Tolk, K Tambets, P Forster, B Karger, P Francalacci, P Rudan, B Janicijevic, O Rickards, ML Savontaus, K Huoponen, V Laitinen, SKoivumaki, B Sykes, E Hickey, A Novelletto, P Moral, D Sellitto, A Coppa, N Al-Zaheri, AS Santachiara-Benerecetti, O Semino, R Scozzari (2001) A signal, from human mtDNA, of postglacial recolonization in Europe AMERICAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS 69 844-852
  • R.Montiel, A.Malgosa, P.Francalacci (2001) Authenticating ancient human mitochondrial DNA. HUMAN BIOLOGY, 73: 689-713
  • O. Semino, G. Passarino, P.J. Oefner, A.A. Lin, S. Arbuzova, L.E. Beckman, G. De Bendictis, P.Francalacci, S. Limborska, A. Kouvatsi, M. Marcikiae, D. Primorac, S. Santachiara-Benerecetti, L.L. Cavalli-Sforza, P.A. Underhill (2000) The genetic legacy of Palaeolithic Homo sapiens sapiens in extant Europeans: a Y-chromosome perspective. SCIENCE 290:1155-1159 (2000)
  • P.A. Underhill, P. Shen, A.A. Lin, L. Jin, G. Passarino, W.H. Yang, E. Kauffman, A. Hurlbut, B. Bonné-Tamir, J. Bertranpetit, P.Francalacci, M. Ibrahim, T. Jenkins, J.R. Kidd, S.Q. Mehdi, M.T. Seielstad, R.S. Wells, A. Piazza, D. Soergel, S. Sherry, M.W. Feldman, R.W. Davis, L.L. Cavalli-Sforza, and P.J. Oefner.(2000) Y Chromosome variation and the History of human populations. NATURE GENETICS 26:358-361
  • L. Morelli, M.G. Grosso, G.Vona, L.Varesi, A.Torroni, P.Francalacci (2000) Frequency distribution of mitochondrial haplogroups in Corsica and Sardinia. HUMAN BIOLOGY, 72: 585-595
  • P.Francalacci, J.Bertranpetit, F.Calafell, P.A.Underhill. (1996) Sequence diversity of the control region of mitochondrial DNA in Tuscany and its implications for the peopling of Europe. AMERICAN JOURNAL OF PHYSICAL ANTHROPOLOGY, 100: 443-460
  • A.Torroni, K.Huoponen, P.Francalacci, M.Petrozzi, L.Morelli, R.Scozzari, D.Obinu, M.L.Savontaus, D.C.Wallace. (1996). Classification of European mitochondrial DNA from an analysis of 3 European populations. GENETICS, 144: 1835-1850

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