Linee di ricerca

1. Identificazione e caratterizzazione di inibitori di virus ad RNA (SARS-2, SARS, MERS e Flavivirus) aventi come target proteine virali funzionali quali Proteasi, Polimerasi, Elicasi.
2. Identificazione e caratterizzazione di inibitori delle attività di DNA polimerasi, ribonucleasi H e integrasi di HIV-1.
3. Studi di caratterizzazione di meccanismi legati alla farmacoresistenza di varianti virali isolate clinicamente.
4. Studi di interazione tra l’integrasi di HIV-1 e la proteina cellulare LEDGF/p75 per identificare potenziali inibitori aventi meccanismo d’azione allosterico.
5. Caratterizzazione dell'evasione della risposta immunitaria umana da parte dei virus ad RNA e identificazione di potenziali inibitori aventi attività immunomodulatoria o antivirale.
6. Caratterizzazione dell'impatto delle infezioni virali a livello della fisiologia cellulare mediante un approccio multiomico.
7. Identificazione e caratterizzazione dei retrovirus endogeni umani (HERV) a livello genomico, analisi comparativa in primati non umani, studio della loro espressione differenziale in contesti patologici d'interesse, valutazione dell'impatto di RNA e proteine HERV sui sistemi cellulari.
8. Caratterizzazione della diversità microbica in ambienti naturali mediante approcci di metagenomica e metatrascrittomica.

Collaborazioni Nazionali ed Internazionali

Università e istituzioni nazionali:

• Università degli Studi di Padova
• Università Federico II (Napoli)
• Università degli Studi di Milano
• Università Torvergata (Roma)
• Università La Sapienza (Roma)
• Ospedale Spallanzani (Roma)
• Università Magna Graecia (Catanzaro)
• Università di Siena
• Università di Perugia
• Università di Parma
• Università di Turnin (Torino)
• Università di Messina
• Università di Palermo
• Università di Pavia
• CNR-IBB (Napoli)
• CNR-IGM (Pavia)

Foreign universities and institutions:

• Leuven University (BE)
• Rega Institute Leuven (BE)
• Taipei University
• Max Plank Institute (DE)
• University of Bayreuth (DE)
• HHMI and UT Health San Antonio (USA)
• University of Maryland (USA)
• Saarland University (DE)
• National Cancer Institute (US)
• Uppsala University (SWE)
• Consejo Superior de Investigaciones Científicas (SP)
• Universitat Autònoma de Barcelona (SP)
• Max Plank (Poland)
• Latvian Biomedical Research and Study Centre (LV)
• University of Lyon (FR)
• Ecole Normale Supérieure Paris (FR)
• Université de Bordeaux (FR)
• Chinese Academy of Medical Sciences – Beijing (CN)
• Volgograd State Medical University (RU)
• University of Copenhagen (Denmark)
• Ruhr University Bochum (Germany)
• Taipei Medical University (Taiwan)
• University of Hamburg (DE)
• Fudan University (Cina)
• University of Amsterdam (Netherland)

Biomed Companies:

• Dompè Farmaceutici (IT)
• Fraunhofer (DE)
• Virostatics (IT)
• Biomerieux (FR)
• HERVolutio Therapeutics (DEN)

Strumentazioni

• 3 laboratori BSL2, dedicati ad attività di ricerca specifiche: uno per studi cellulari, uno per infezioni virali e uno per la manipolazione di cellule batteriche.
• 5 laboratori per i diversi studi di biologia molecolare ed enzimatica, tra cui complessivamente: 1 robot Hamilton Microlab STARlet M, 2 lettori di piastre multipozzetto Nivo 5 (PerkinElmer), 1 sistema di imaging ChemiDoc MP (BioRad), 1 dispenser per piastra multipozzetto automatizzato al nanolitro iDot (Dispendix), 1 NanoDropOne(Thermofisher), 1 transilluminatore UV, 1 incubatore agitante (sistema Optic Ivymen), 1 spettrofotometro (PerkinElmer), 2 agitatori termostatati per la crescita di batteri, 1 cold box, 2 microcentrifuga da banco (Eppendorf), 2 centrifughe ad alta velocità J2-21 (Beckman), 1 Ultracentrifuga refrigerata Optima XPN 90(Beckman), 1 elettroporatore GenePulser XcellTM Total System (BioRad), 1 trans-blot turbo (Biorad), 1 nanodrop, 3 apparati SDS-PAGE, 3 apparati per elettroforesi su gel di agarosio, 3 alimentatori, 1 apparato PCR in tempo reale (CFX Biorad); strumenti generali quali 2 cappe chimiche, 1 autoclave verticale da 85L, frigoriferi da 4 °C, congelatori da -20 °C, 3 congelatori da -80 °C, 2 agitatori per la crescita batterica, 2 pHmetri, 2 incubatori ad acqua, 3 sonicatori a bagnomaria e altri piccoli apparati.
• 1 cella frigorifera da 4 °C dotata di 1 sistema Biological LP FPLC (BioRad), 1 AKTA Pure 25M.
• 1 laboratorio per acquisizione di immagini in fluorescenza, 1 microscopio a fluorescenza con telecamera (leika THUNDER Imager), 1 ONI Nanoimager, 1 sistema di imaging ad alta risoluzione Citation 5 (Agilent - Biotek).
• 1 laboratorio di bioinformatica con 4 computer ad alte prestazioni e accesso a un servizio di elaborazione ad alta potenza per l'archiviazione e l'analisi sicure di grandi set di dati trascrittomici presso il centro interdisciplinare regionale CRS4 per studi avanzati, ricerca e sviluppo.
• Accesso a una struttura BSL-3, per studi virologici con agenti virali di classe 3.